La hilera del cafetal debe mantenerse libre de hierbas, en las calles del cafetal no deben extenderse demasiado, no tener raíces profundas y no pasar de la altura de la bota; por lo que se recomienda:
• Eliminar selectivamente las peores hierbas: bejucos, zacates y perennes de hoja ancha.
• Controlar las hierbas bajas, especialmente aquellas que poseen raíces superficiales.

La selección y manejo de hierbas se las puede hacer de la siguiente manera:
• Control manual con machete.
• Control mecánico con motoguadaña.
• Presencia de sombra que provee el sistema agroforestal reduciendo la entrada de luz al suelo del cafetal.
• Manteniendo la hojarasca y ramas podadas del cafetal y de los árboles de sombra (coberturas muertas)